출쳐: A Transcriptome Sequencing Study on Genome-Wide Gene Expression Differences of Lung Cancer Cells Modulated by Fucoidan - PubMed (nih.gov)
2022 Mar 1;10:844924. doi: 10.3389/fbioe.2022.844924. eCollection 2022.
A Transcriptome Sequencing Study on Genome-Wide Gene Expression Differences of Lung Cancer Cells Modulated by Fucoidan
Yanjie Zhao 1 2, Xinmei Li 2, Heng Zhang 2, Mingzhe Yan 1, Mengmeng Jia 1 2, Qihui Zhou 1
Affiliations
PMID: 35299642 PMCID: PMC8923512 DOI: 10.3389/fbioe.2022.844924
Free PMC article
Abstract
Fucoidan has received increasing attention in anti-(lung) tumors. However, the effect of fucoidan on the gene changes of lung cancer cells (LCCs) has not been examined systematically. Herein, we investigate the effect of fucoidan on the phenotypes of LCCs and their gene expression by transcriptome sequencing analysis. The phenotypes of LCCs are significantly inhibited by fucoidan. Importantly, compared to LCCs, 1 mg/ml fucoidan has no effect on the phenotypes of normal cells. Further, 6,930 differentially expressed genes (DEGs) in the transcriptome of LCCs (3,501 up-regulated and 3,429 down-regulated genes) are detected via RNA-sequencing between the fucoidan and control groups. Gene Ontology analysis confirms that DEGs are reflected in DNA replication, cell-substrate junction, regulation of cell cycle phase transition, apoptosis, focal adhesion, cadherin binding, and cell adhesion molecule binding. Thus, our findings on the transcriptomic level highlight the therapeutic potential of fucoidan for lung cancer treatment.
구글 번역
2022년 3월 1일;10:844924. doi: 10.3389/fbioe.2022.844924. 전자 컬렉션 2022.
후코이단으로 조절된 폐암 세포의 게놈 전체 유전자 발현 차이에 대한 전사체 염기서열 분석
Zhao Yanjie 1 2, Xinmei Li 2, Heng Zhang 2, Mingzhe Yan 1, Mengmeng Jia 1 2, Qihui Zhou 1 제휴 확장 PMID: 35299642 PMCID: PMC8923512 DOI: 10.3389/fbioe.2022.844924 무료 PMC 기사
내용 요약
후코이단은 항(폐) 종양에서 점점 더 주목받고 있습니다.
그러나 후코이단이 폐암 세포(LCC)의 유전자 변화에 미치는 영향은 체계적으로 조사되지 않았습니다.
여기에서는 전사체 시퀀싱 분석을 통해 후코이단이 LCC의 표현형과 유전자 발현에 미치는 영향을 조사합니다.
LCC의 표현형은 후코이단에 의해 현저하게 억제됩니다.
중요한 것은 LCC에 비해 1mg/ml 후코이단이 정상 세포의 표현형에 영향을 미치지 않는다는 것입니다.
또한, LCC의 전사체에서 6,930개의 차등 발현 유전자(DEG)(3,501개의 상향 조절된 유전자 및 3,429개의 하향 조절된 유전자)가 후코이단과 대조군 사이의 RNA 시퀀싱을 통해 검출됩니다.
유전자 온톨로지 분석은 DEG가 DNA 복제, 세포-기질 접합, 세포 주기 상전이의 조절, 세포자멸사, 국소 접착, 카드헤린 결합 및 세포 접착 분자 결합에 반영된다는 것을 확인합니다.
따라서 전사체 수준에 대한 우리의 연구 결과는 폐암 치료를 위한 후코이단의 치료 가능성을 강조합니다.
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