≪ 요 약 ≫ 1. 식물과 공생하는 마이크로바이옴 마이크로바이옴이란 식물, 동물 등과 더불어 살아가는 미생물 전체로 이들의 유전정보까지 포함한 개념이다. 미생물이 서식하는 장소는 인체, 식물, 토양 등 없는 곳이 없는데 서식지 환경에 맞추어 마이크로바이옴이 자리 잡게 된다. 식물과 밀접한 관계에 있는 미생물에는 대표적으로 세균, 진균, 바이러스 등이 있으며 식물과 공생한다. 마이크로바이옴의 영역은 크게 근권, 내권, 엽권으로 나눌 수 있는데, 근권은 살아있는 뿌리가 영향을 주는 토양 영역, 내권은 식물체 내부, 엽권은 주로 잎에 사는 미생물의 서식지를 뜻한다. 식물은 미생물에게 안전하고 먹거리가 풍부한 환경을 제공하고 미생물은 안락한 보금자리를 찾아 정착한다. 식물은 발달시기, 환경조건에 따라 특정한 물질을 뿌리 분비물로 배출함으로써 식물 생육에 필요한 미생물을 초대한다. 2. 마이크로바이옴의 잠재능력 최근 마이크로바이옴이 주목받고 있는 기능을 살펴보면 첫째, 식물은 성장과정 중에 다양한 스트레스 상황에 직면하는데, 식물 마이크로바이옴은 이런 스트레스 감소에 기여한다. 둘째, 식물도 동물처럼 면역체계를 가지고 있는데 식물 마이크로바이옴은 식물의 면역력 높이기도 한다. 셋째, 일반적으로 토양에 유기물이 증가하면 식물 주변 미생물이 활발해져 병원균의 생장을 억제한다. 넷째, 식물체와 상호작용하는 마이크로바이옴 조성에 따라 개화시기가 현저하게 차이나는 사례가 보고되기도 했다. 다섯째, 식물이 생육을 저해하는 특정 미생물의 특성을 이용하여 잡초의 생물학적 방제에 적용하기도 한다. 여섯째, 석유, 중금속, 농약 등에 오염된 토양 복구에 미생물의 상호작용을 이용하면 정화 효율을 높일 수 있다. 마지막으로 텃밭 활동 등으로 식물과 마이크로바이옴에 자주 노출되고 미생물이 풍부한 농산물을 먹게 되면 건강에도 긍정적 영향을 미친다. 3. 시사점 미생물은 지구상에서 가장 수가 많고 생태계의 근간을 이루기도 하는 마이크로 바이옴의 가치와 활용도를 잘 인식해야한다. 또한 농업의 지속가능성을 지켜 줄 수 있는 기술로 미생물을 활용한 농업기술이 크게 주목받고 있는데 이를 단순한 농업기술이 아닌 농업의 패러다임으로 이해해야 한다. 국외에 비해 R&D예산 비율이 낮고, 인력과 인프라가 약하므로 이를 극복할 수 있는 일점 집중 타격전략이 필요하다. Ⅰ. 식물과 공생하는 마이크로바이옴 마이크로바이옴(Microbiome)이란? □ 마이크로바이옴이란 식물, 동물 등과 더불어 살아가는 미생물 전체로 이들의 유전정보까지 포함한 개념 ○ 마이크로바이옴은 기주(寄主) 생물과 떼려야 뗄 수 없는 동·식물 생태계의 핵심 구성원 * 기주와 마이크로바이옴을 합쳐 메타유기체(meta-organism)라고 부르기도 하는데, 이는 기주와 마이크로바이옴을 하나의 연합체로 보는 개념 □ 미생물이 서식하는 장소는 인체, 식물, 토양 등 없는 곳이 없는데 서식지 환경에 맞추어 마이크로바이옴이 자리 잡게 됨 ○ 인체마이크로바이옴은 인간의 몸 안팎에 서식하고 있는 미생물들과 그 미생물들의 유전정보 전체를 말하는 것(‘17 한국보건산업진흥원) - 인체 부위 중 장(腸)내에 가장 많은 숫자의 미생물이 서식하고 있어 장내 마이크로바이옴을 인체마이크로바이옴이라 하기도 함 * 장내 마이크로바이옴(intestinal microbiome)은 그 수와 다양성이 매우 커서 제2의 인간 유전체(second genome)라고도 함 - 인체 내 미생물의 역할을 구명하고 이를 활용해 헬스 케어, 의약품 등으로 이용하려는 연구가 활발 ○ 식물마이크로바이옴은 식물 내부와 주변에 미생물이 서식하면서 식물의 생육에 큰 영향을 미치고 있음 - 뿌리, 줄기, 잎, 꽃, 과실, 종자 등 모든 식물 기관에서 발견되고 부위마다 미생물의 종류가 달라 하는 역할도 제각각 - 마이크로바이옴의 영역은 뿌리의 영향을 받는 주위의 토양을 일컫는 근권, 식물체 내부인 내권, 잎의 표면을 말하는 엽권으로 나뉨 * 근권(rhizosphere), 내권(endosphere), 엽권(phyllosphere)
* 출처 : Journal of Citrus Pathology, 2015, Wang,N 식물마이크로바이옴의 구성원들 □ 식물과 밀접한 관계에 있는 미생물에는 대표적으로 세균, 진균, 바이러스 등이 있으며 식물과 공생 ○ 세균(bacteria)은 가장 다재다능한 능력을 보여주는 생물체로 항생물질과 호르몬 생산, 면역과 스트레스 조절 등의 기능이 있음 - 항생물질과 해충용 독(毒), 식물생육 촉진 호르몬, 면역반응 자극과 스트레스 반응 조절물질 분비 * 뿌리 주변 토양 1 그램(g)당 세균은 1만 종 이상, 세포 수로는 100억 개 이상
○ 보통 곰팡이를 의미하는 진균(fungi)류는 뿌리이자 줄기 역할을 하는 균사(菌絲)를 땅 속으로 뻗어 식물의 영역을 넓혀줌 - 뿌리 주변 토양, 뿌리 표면과 내부까지 서식하며 세포 수로 토양 1 그램(g)당 10만~100만 개 이상 존재 * 긴 실모양의 균사를 통해 식물 뿌리가 닿지 않는 곳까지 확장하여 양분, 무기질, 물을 흡수하여 식물을 돕는 역할 ○ 바이러스는 지구상에서 가장 개체수가 많은 생물체로, 모든 생물은 최소 하나 내지는 여러 바이러스와 같이 살고 있음 - 병원성 바이러스가 많이 알려져 있으나 생태계에서는 오히려 스트레스를 줄여주는 역할도 담당 마이크로바이옴의 영역 1, 근권(根圈, Rhizosphere) □ 근권이란 살아있는 뿌리가 영향을 주는 토양 영역으로 식물 뿌리 주변은 미생물들의 좋은 생활터전 ○ 뿌리 주위의 수 밀리미터(mm) 공간에 불과하지만 식물이 자라지 않는 토양에 비해 약 10배에서 100배 이상의 세균이 서식 - 보통 토양 1g에는 대략 약 1억 마리의 세균이 서식하나, 근권에는 최소 그 10배 이상의 세균이 존재
□ 식물 뿌리와 함께 살아가야 하는 근권미생물은 생존을 위한 그들만의 특수한 전술을 구사 ○ (협동) 뿌리혹박테리아와 같은 미생물들은 생존을 위해 식물과 한 몸과 같이 사는 방법을 터득 - 콩과식물 뿌리에 혹을 형성하여 식물로부터는 먹이(탄소)를 얻고, 공중질소를 식물이 이용할 수 있는 형태로 만들어 공급 * 라이조비움(Rhizobium)과 브래디라이조비움(Bradyrhizobium) 등 ○ (전투) 다른 미생물과 양분 혹은 서식지 경쟁에서 이길 수 있도록 도와주는 항생물질을 만들어 식물의 병저항성을 높이는 전략 * 항생물질 생산에 흔히 쓰이는 슈도모나스(Pseudomonas), 바실러스(Bacillus), 스트렙토마이세스(Streptomyces) 등이 대표적 ○ (상부상조) 바실러스나 슈도모나스 등은 토양과 강하게 결합하여 식물이 흡수 할 수 없는 영양분을 이용가능하게 바꾸어 줌 - 뿌리 근처에 살면서 흙 알갱이와 화학적으로 강하게 결합된 인산(P)같은 양분을 식물이 이용하기 쉬운 형태로 바꾸어 줌 * 세계 각국에서 비료 대신 사용할 목적으로 연구 중인 미생물로 인산가용화균을 비롯한 다양한 명칭이 있으며 생물비료라고 부르기도 함 마이크로바이옴의 영역 2, 내권(內圈, Endosphere) □ 내권이란 식물체 내부를 의미하며 내권에서 서식하는 미생물을 내생미생물(endophytes)이라 함 ○ 식물 내부에서 전체 생활사의 일부 또는 전부를 보내는 미생물로 눈에 띄는 해를 입히지 않는 것이 특징 - 이들 미생물은 자신의 생활사를 완성하기 위해 다양한 방법으로 식물 조직에 침투하는 방법을 발달시켜옴 □ 일부 내생미생물은 식물을 병원균으로부터 지켜주거나 생육에 도움을 주기도 함 ○ 내생미생물이 존재하는 식물의 경우 그렇지 않은 식물에 비해 병원균에 대한 저항성 및 내성이 높은 것으로 알려짐 - 전신유도저항성(induced systemic resistance, ISR)이라고 하여 특정 물질을 생성해 기주식물이 스스로 방어체계를 형성할 수 있도록 유도 * 에틸렌과 자스몬산은 식물이 실제로 어려운 상황에 빠진 것처럼 착각하게 하여 병원균의 공격에 미리 대비하도록 하는 일종의 ‘예방주사’와 같은 역할 - 내생미생물은 기주식물을 외부 스트레스로부터 보호하는 다양한 2차 대사산물(생리활성물질)을 만드는 재주가 있는 경우가 많음
마이크로바이옴의 영역 3, 엽권(葉圈, Phyllosphere) □ 엽권이란 주로 잎에 사는 미생물의 서식지를 뜻하며 이곳에 서식하는 거주자가 엽권미생물 ○ 식물 잎 표면에 있는 미세 통로에 집중적으로 분포하는데, 유기물과 무기물의 흡수배출 통로이기 때문
□ 대부분은 비병원성으로 식물과 밀접한 상호관계를 이루고 있으며, 외부자극에 이겨내기 위한 필수 생존전략을 보유 ○ 주로 대기 중에 노출되어 있어 영양이나 수분 부족 등 다양한 스트레스 상황에 적응할 수 있는 다양한 생존능력을 보유 식물과 마이크로바이옴이 만드는 세상 □ 식물은 미생물에게 안전하고 먹거리가 풍부한 환경을 제공하고 미생물은 안락한 보금자리를 찾아 정착 ○ 식물은 광합성으로 고정된 탄소의 6~21%를 뿌리를 통해 분비하는데 이 뿌리 분비물이 미생물의 먹이 - 뿌리 분비물에는 탄수화물, 아미노산, 유기산, 이차대사산물, 신호전달물질 등 다양한 형태의 화합물이 포함 ○ 미생물은 먹이를 찾아 뿌리 주변으로 몰려들고, 미생물간의 경쟁, 협력관계를 이루며 미생물 공동생활체를 이룸 - 식물 뿌리와 공생하는 곰팡이는 균사를 뻗어 세균들에게 새로운 서식처를 제공하여 식물-곰팡이-세균 사이에 유기적인 관계를 맺음
이로운 미생물에게 보내는 초대장 □ 식물은 발달시기, 환경조건에 따라 특정한 물질을 뿌리 분비물로 배출함으로써 식물 생육에 필요한 미생물을 초대 ○ 플라보노이드(flavonoid)는 뿌리혹박테리아를 불러들여 뿌리혹을 형성하도록 유도하여 적극적으로 공생 관계를 맺음 ○ 스트리고락톤(strigolactone)은 균근균의 균사 발달을 촉진하여 식물의 인산 흡수 효율을 높임 * 균근균은 식물 뿌리세포와 공생관계를 맺고 있는 곰팡이의 일종으로 식물로부터 유기영양분을 공급받고, 무기영양소와 수분 흡수를 도와줌 ○ 식물이 병원균에 감염되었을 때는 사과산(malic acid)을 분비해 항생물질을 분비하는 바실러스균을 유인 - 바실러스균이 분비하는 물질은 식물의 병원균 저항성을 강화시켜 (유도저항성) 효과적인 식물 방어 시스템을 구축하도록 함
Ⅱ. 마이크로바이옴의 잠재능력 최근 주목받고 있는 기능 Ⅰ, 저항성 증진 □ 식물은 성장과정 중에 다양한 스트레스 상황에 직면하는데, 식물 주변 미생물(마이크로바이옴)은 이런 스트레스 감소에 기여 ○ 프롤린, 콜린, 트리할로스 등 미생물이 직접 분비하거나 식물이 합성하도록 신호를 주는 물질이 스트레스 저항력을 증가 * 외부로 분비하는 다당류(세포외다당류)의 경우는 토양의 수분 유지, 식물 내 단백질과 당 함량, 항산화 효소의 활성을 증가 ○ 휘발성 물질(2R, 3R-butanediol 등)은 기공 개폐를 조절하여 식물의 수분 손실을 막고 건조 내성을 증가 - 공중 습도가 높고 기온이 적당하면 기공을 열고, 습도가 낮고 온도가 높을 경우에는 기공을 닫아 식물체내 수분을 보존 ○ 식물 뿌리 주변에 사는 근권미생물은 병원균과 양분 경쟁을 하거나 항생 물질을 분비하는 방법을 통해 병원균의 생장을 저해 ○ 미생물이 분비하는 물질(비스코신, 서팩틴, 펜지신 등) 등은 식물의 저항성을 유도하거나 항균효과를 나타내기도 함 * 식물·미생물이 자체적으로 병원균을 인식하게 되면, 식물호르몬 시스템을 조절하여 병해충 저항성을 유도할 수 있음(유도저항성) 최근 주목받고 있는 기능 Ⅱ, 면역력 증가 □ 식물도 동물처럼 면역체계를 가지고 있는데 식물 주변 미생물(마이크로바이옴)은 식물의 면역력 높이는데 기여 ○ 해로운 미생물을 인식하는 다양한 수용체를 통해 외부의 신호를 내부로 전달하는 체계가 동물의 면역과 유사 ○ 식물 면역을 높여주는 중요 인자는 미생물의 세포벽 구성물질과 미생물의 분비물 - 진균류(곰팡이)의 세포벽 주요 성분인 키틴과 글루칸, 세균의 지방다당질과 다당류는 미생물을 인식하는데 중요한 역할 - 세균의 편모 구성 물질(플라젤린 등)도 병원균을 인식하여 식물의 면역반응을 일으키는 요소 ○ 에틸렌, 자스몬산, 살리실산, 비타민(티아민, 리보플라빈 등), 단백질(harpin 등), 휘발성 물질 등은 대표적인 면역유도물질 * 미생물이 분비하는 리포펩타이드(lipopeptide, suffactin, fengicin, iturin 등)는 낮은 농도에서 강력한 면역유도 효과를 나타냄 ○ 식물 면역력을 증가시키는 미생물은 장기간 효과가 지속되고 광범위한 효과가 있다는 특별한 장점이 있음 최근 주목받고 있는 기능 Ⅲ, 병이 없는 토양환경 조성 □ 일반적으로 토양에 유기물이 증가하면 식물 주변 미생물이 활발해져 병원성 미생물 생장을 억제 ○ 병 발생 억제토양(suppressive soil)은 토양 유래 병원균이 존재하지만 식물의 병이 발생되지 않거나 발생률이 적은 토양 - 토양에 존재하는 슈도모나스(Pseudomonas) 등의 특정 미생물이 항진균 물질을 분비하여 병원균을 저해 * 밀 마름병 병원균 발생을 저해하는 특이한 토양이 밀 연작지에서 실제로 발견
□ 병 발생이 억제된 토양을 혼합하거나 미생물의 다양성을 높여주는 방법을 통해 쉽게 만들 수 있음 ○ 병 발생 억제토양 일부분을 병이 쉽게 발생하는 토양과 혼합하기만 해도 병 발생률이 현저히 감소 - 식물 주변 미생물(마이크로바이옴)의 다양성이 높으면 병원균의 증가가 억제되고, 환경변화에 따른 회복력도 빠름 최근 주목받고 있는 기능 Ⅳ, 식물의 개화시기에도 관여 □ 식물체와 상호작용하는 마이크로바이옴 조성에 따라 개화시기가 현저하게 차이나는 사례가 보고 ○ 미생물은 식물 호르몬, 펩타이드, 효소 등 다양한 식물 생리조절 물질을 분비하는데, 구성에 따라 활성화되는 기능이 달라짐 ○ 특정한 식물의 표현형을 유도할 수 있는 마이크로바이옴의 구조와 특성을 밝히고자 각국에서 활발한 연구가 진행 중 최근 주목받고 있는 기능 Ⅴ, 잡초 제거 □ 식물이 생육을 저해하는 특정 미생물의 특성을 이용하여 잡초의 생물학적 방제에 적용 ○ 특정 잡초에 선택적으로 병을 일으키는 병원균을 이용하여 잡초의 생장도 억제가 가능 * 농진청에서 개발한 미생물 제초제 다이클로버는 콩과식물에 병을 일으키는 곰팡이균으로 잔디밭과 농경지에서 클로버만 선택적으로 제거 ○ 일부 토양 미생물이 잡초 종자발아를 억제하여 초기 발생을 억제하는 친환경 제초제 역할을 한다는 연구결과가 보고 * 현재 사용되고 있는 제초제는 주로 땅 위로 자란 잡초의 생육을 직접적으로 억제하거나 생육이 어렵게 만들어 고사(枯死)시키는 화학물질 - 토양에 유기물을 공급하면 미생물 수와 이들이 분비하는 효소 활성이 증가하여 잡초 종자의 부패를 촉진 * 푸사리움(Fusarium oxysporum) 같은 미생물은 종자활성을 저해
최근 주목받고 있는 기능 Ⅵ, 토양 오염물질 정화 □ 석유, 중금속, 농약 등에 오염된 토양 복구에 미생물의 상호작용을 이용하면 정화효율을 극대화 ○ 식물은 분해 미생물의 서식지를 제공하고, 오염물질이 이동할 수 있는 공간을 늘려서 분해효율을 높임 - 뿌리 분비물은 오염물질 분해 미생물의 영양분이 되어 미생물의 생장과 활성을 촉진 - 또한 뿌리 분비물에 포함된 산화효소들이 오염 물질을 분해하는데 촉매제 역할을 함 * 뿌리로부터 3mm 이내에 있는 토양에서 오염물질 분해효율이 가장 높았음 ○ 오염물질이 토양 알갱이에 흡착되어 있는데 뿌리 분비물이 이들의 용해도를 높이면 미생물이 분해하는 협업을 하기도 함 * 유해물질 분해제의 대부분이 토양 미생물로부터 분리하여 얻은 천연물 최근 주목받고 있는 기능 Ⅶ, 건강에도 기여 □ 텃밭 활동 등으로 식물과 미생물(마이크로바이옴)에 자주 노출되고 미생물이 풍부한 농산물을 먹게 되면 건강에도 긍정적 영향을 미침 ○ 다양한 토양 미생물에 대한 노출도 인체의 면역력을 증진시켜서 알레르기, 아토피 등의 현대 병 발생도 감소 - 식물체와 같이 살고 있는 다양한 토양 미생물을 섭취함으로써 인체 내 미생물과 공생 또는 자극으로 작용 □ 식물 호르몬이 인체의 생리작용 조절뿐만 아니라 인체의 각종 질병 예방에도 기여(Chanclud and Lacombe, 2017, 리뷰논문 참고) ○ 식물 스트레스 호르몬인 앱시스산은 인슐린 분비를 촉진시켜 당뇨병을 완화한다는 연구결과가 있음(Ameri et al., 2017) ○ 지베렐린은 사람 체내에서 염증유발 물질인 인터루킨의 분비를 억제하여 염증질환을 완화(Reihill et al., 2015) ○ 옥신은 체내에 흡수되면서 암세포 내 세포독성 활성산소 농도를 높여 암세포 증식을 억제
식물호르몬이 인체에 미치는 영향 Ⅲ. 시사점 마이크로바이옴의 가치와 활용도를 잘 인식해야 □ 미생물은 지구상에서 가장 수가 많고 생태계의 근간을 이루기도 하는 생물이며 아직도 밝혀지지 않은 것이 많은 보고(寶庫) ○ 순수한 미생물 관련 분야의 세계 시장규모만 연간 약 100억 불(약 10조 원) 정도로 추정(‘10 한국바이오안전성센터) - 미생물이 생산하는 항생제 등의 의약품을 합치면 미생물은 세계 바이오제품 시장의 30%를 차지 ○ 용도가 부품(biobricks), 인공세포(artificial cell) 같은 합성생물학(synthetic biology) 분야까지 확장되면서 산업계에서도 주목 * 의학, 식품, 당류, 세제, 섬유, 펄프, 동물용, 화학 및 화장품 이외에 에너지 등에도 광범위하게 사용 단순한 농업기술이 아닌 농업의 패러다임으로 이해 □ 현재 농업의 가장 큰 흐름인 지속가능성을 지켜줄 수 있는 기술로 미생물을 활용한 농업기술이 크게 주목받고 있음 ○ UNICEF 등에서는 세계 식량부족을 해결하면서도 환경을 보존하는 기술로 각국의 전통농업기술을 발굴.적용 * 대부분이 퇴비 등 발효미생물이나 미생물배양에 의한 작물의 보호, 생물비료, 토양 오염감소 등의 효과를 거두는 기술 ○ 미국, 캐나다, EU, 일본, 중국 등에서도 기술 선점을 위해 집중 투자 중인 분야로 지적재산권의 가치도 매우 높음 * 바스프(BASF), 바이엘(Bayer CropScience), 몬산토(Monsanto) 등 기업들도 토양 미생물 연구에 약 2조 원 이상의 연구비를 투자 국가 차원의 일점 집중 타격 전략이 필요 □ 국외에 비해 R&D예산 비율이 낮고, 인력과 인프라가 약하므로 이를 극복할 수 있는 일점집중 타격전략이 가장 효율적일 것 ○ 미국, 일본, 중국 등의 국가에 비해 기술수준은 비슷하나 인원, 연구비, 연구 분야는 현저히 열세로 물리적으로 극복이 어려움 - 각 부처와 연구기관 간의 강력한 케미스트리를 발생시켜 특정 목표에 집중, 지적재산권을 선점하는 국가차원의 전략이 요구 [출처] 식물을 이해하는 또 다른 방법-함께 사는 미생물, 마이크로바이옴|작성자 종주
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