How kind of you 는 '구(a phrase)'의 형태이며,
How kind you are 는 '문장(a sentence)'입니다.
둘 다 다음의 문장을 변형시킨 것입니다.
You are kind ~ 혹은 You must be kind ~
1) How kind of you! (= It's kind of you!)
eg) How kind of you to help the poor girl.
= It's kind of you to help the poor girl.
(그 불쌍한 여자애를 도와주다니, 너 참 친절하구나!)
2) How kind you are.
eg) He doesn't know how kind you are.
(그는 네가 얼마나 친절한지 모르고 있어.)
일반적으로 어법 책에 잘못나와 있는 것 중 하나..
It's kind of you to help the poor girl.
분명 kind를 '인성 형용사(사람의 성격)'이라고 했습니다.
다음과 같은 변화입니다.
You are kind to help the poor girl.
How kind of you to help the poor!
It's kind of you to help the poor.
of 생략 불가이며, it은 가주어가 아니라 '비인칭주어(an impersonal subject)'입니다. native speaker들이 보는 각종 용법사전에도 잘 나와 있습니다.
상당수의 한국에서 통용되는 문법책은 생략이 가능하다는 둥, 가주어(placeholder 또는 a provisonal subject)라는 둥 그러지만 옳지가 않습니다.
사전적 오류도 있습니다. 전통적으로 한국에서 봐왔던 '두산동아프라임 사전'인데 참고로 이 사전은 최초에 일본사전을 그대로 번역해서 사용했던 사전입니다.

해당 사전의 오류입니다.
(번역본 사전 종종 틀리는 경우 있습니다. 틀렸다의 기준은 해당 원어민이
가장 선호하고 신뢰하는 자료가 근거가 됩니다.)
It's kind of you to help me.
여기서 'it'은 사실상 가주어(placeholder)가 아닌데, 두산 동아사전으로 인해서 더 혼란스러워졌고,
한 단계 더 나아가 생략이 가능하다는 쓰레기 문법책들도 있습니다.
참고가 되셨길.