5.6 Prediction of rice embryo proteins using EST-Databases

[장아미]

An attempt was made to link rice embryo proteins to DNA sequences and to ubderstand their functions.

쌀 배 단백질을 DNA서열에 연결시키려는 것과 쌀 배 단백질 기능을 이해하는 것에 관한 시도가 이루어졌다.

One hundred of the 700 spots detected on the embryo 2-DE gel were microsequenced.

2-DE gel에서 탐지한 배 700 지점중 100개는 잘못 배열되었다.

Of these, 28% of the embryo proteins were matched to DNA sequences with known functions, but 72% of the proteins were unknown in functions as previously reported(woo etal 2002).

그 배 단백질들 중 28%는 알려진 기능을 가진 DNA 배열과 짝이 이루어지지만 72%단백질은 이미 보고한 바와 같이 기능이 잘 알려지지 않았다.(woo etal 2002)

In addition twenty-four protein spots with 100% of homology and nine with over 80% were matched to ESTs(expressed sequence tags) after expanding the amino acid sequences of the protein spots by Database searched using the available rice EST databases at the NCBI(http://www/ncbi.nim.nih.gov/)and  DDBJ(http://www.ddbj.nig.ac.jp/).

덧붙여서 NCBI(http://www/ncbi.nim.nih.gov/)와 DDBJ(http://www.ddbj.nig.ac.jp/)가 데이터배이스 연구에서 사용가능한 쌀 EST 데이터베이스를 이용해 단백질 장소 아미노산 서열을 확장한 후 100%상동인 24가지 단백질 지점과 80%이상의 상동인 9가지 단백질 지점은 ESTS와 짝을 이룬다.

The chromosomal location of some proteins were also obtained from the rice genetic map provided by Japanese Rice Genome Research Program (http://rgp.dna.affrc.go.jp).

약간의 단백질 염색체 장소는 일본 쌀 게놈 연구 프로그램에 의해서 제공된 쌀  유전자 지도로부터 얻어진다.

The DNA sequence database including EST have been reported for rice (oryza sativa L.) nowprovides whole or partical gene sequence, and recent advances in protein characterization allow the linking proteins to DNA sequences in the functional analysis.

쌀에 대해 보도해 왔던 EST를 포함한 DNA 서열 데이터베이스는 지금은 전체 또는 부분 유전자 서열을 보도하고 있으며 단백질 평가에 대한 최근 발전은 DNA 기능 분석에 관한 서열에 연결질 수 있도록 해 준다.

This work shows that proteome analysis could be useful tool strstegy to link sequence information and  to functional genomics.

이것은 단백질 유전정보 분석이 서열정보를 연결 지을 수 있도록 해 주는 것과 기능적 유전에 관해서는 유용한 전략 도구가 된다는 것을 보여준다.