질문 있습니다!

[sdfmksd]

기본이론 질문 있습니다!!

1.p 304에 발전된 PCR 내용에서

2단계의 경우 18염기이상으로 짜야되는게 1/4의 18승했을 경우 30억 염기쌍중 딱 한곳만 결합할수있어서 한다고 하셨는데

갑자기 Tm값은 절반은 결합하고 절반은 결합하지 않는다고 하셨어요. 이 이유가 무엇인가요? 앞에는 18염기가 다 결합하는게 30억염기쌍중 하나라고 해서 다 결합하는거라 설명하다가 갑자기 Tm설명할때는 절반은 결합하고 절반은 결합안한다고 해서 혼란이 오네요..

2.p325에 RNA pol이 종결자 서열에 다다르면 진행을 안하고 멈춘다고하는데 멈추는 이유는 무엇인가요??

어떤 원리로 종결자 서열에서 멈추는지 궁금합니다!

3.p325에 Rna pol이 결합한 이후 로우 단백질이 helicase 활성으로 stem loop 구조를 풀어나가면서

진행한다고 하는데 있어서 왜 앞에 stem loop구조는 안푸는것인가요??

4. 인트론과 스페이서의 차이가 구분이 안되네요.. 둘다 엑손사이에 있는 부위 즉 동의어로 봐도 될까요?

5.p368에 보면 +RNA2개에 동그란 작은게 달려있고 이게 뉴클레오 캡시드라고 하셨는데

그 바깥쪽에 전체를 감싸고 있는 하늘색 동그란 부분은 뭐라고 봐야할까요??

단백질이 RNA에 직접 결합해있는 부분도 있고 하늘색으로 해서 또 껍질이 있다고 봐도 될까요?

6. 전이인자가 원핵 진핵 다관찰된다고 되어있는데 레트로트랜스포존의 경우 RNA pol2에 의해 전사된다고 해요.

그럼 전이인자중에 트랜스포존은 원핵 진핵 다 관찰이고 레트로트랜스포존은 진핵세포에서만 관찰되나요??

[김희종]

1. 프라이머를 18mer 이상으로 짜야 프라이머가 유전체 DNA에서 내가 원하는 곳에만 특이적으로 결합하게 됩니다. 그리고 Tm 온도에서 annealing을 하게 되면, 넣어준 프라이머의 절반 (9mer)이 내가 원하는 곳에 상보적으로 결합하게 된다는 뜻입니다. 이해가 되었기를 바랍니다.

[김희종]

2. 수업시간에 원핵생물의 전사 종결에서 RNA polymerase가 종결자 서열에서 멈추게 되는 메커니즘은 ρ–dependent 전사 종결과 ρ–independent 전사 종결에서 똑같기 때문에, ρ–independent 전사 종결을 설명할 때 한꺼번에 설명한다고 말씀드렸습니다. 그리고 ρ–independent 전사 종결을 설명할 때 이 부분에 대해서 자세하게 설명을 드렸습니다. 수업 내용을 놓치지 말고 꼼꼼하게 들으시기 바랍니다.

[김희종]

3. 제가 rho 단백질은 helicase 활성을 통해 stem-loop 구조를 풀면서 지나간다고 말로 설명을 드렸습니다. 그런데 그림에 그대로 stem-loop 구조가 남아있는 것은 rho 단백질이 stem-loop 구조를 풀더라도 rho 단백질이 지나가버리면 stem-loop 구조가 다시 형성되기 때문입니다.

[김희종]

4. 엑손은 RNA에서 암호화 부위 내 두 엑손 사이에 있는 부위입니다. 스페이서는 RNA에서 두 암호화 부위 사이에 있는 부위입니다. 따라서 엑손과 스페이서는 완전히 다릅니다.

[김희종]

5. 책에 해당 부분이 캡시드라고 표시되어 있습니다.

[김희종]

6. 네. 전이인자는 원핵 진핵에서 모두 관찰되고, 레트로트랜스포존은 오직 진핵에서만 관찰됩니다. 레트로트랜스포존이 진핵에서만 관찰된다는 점은 피트 시험에서 필요한 내용이 아니라는 점도 같이 알려드립니다.