중국 CDC에서 GISAID에 대해 발표한 SARS-CoV-2 메타게노믹스 데이터에 대한 SAGO 성명

[힘힘]

중국 CDC에서 GISAID에 대해 발표한 SARS-CoV-2 메타게노믹스 데이터에 대한 SAGO 성명 

18/03/2023 

2023년 3월 12일 WHO는 2020년 1월부터 중국 우한시 환안수산물도매시장에서 수집된 샘플과 관련된 새로운 SARS-CoV-2 염기서열과 메타게노믹스 데이터를 알게 되었고, 단기간 동안 GISAID에서 사용할 수 있게 되었다.그그 후 여러 나라의 많은 연구자들에 의해 데이터가 다운로드되었다.중국 CDC에 의한 추가 데이터 갱신을 허용하기 위해 접근이 제한되었습니다.WHO는 즉시 중국 CDC와 SAGO 의장 및 부회장에게 연락을 취했습니다.WHO와 중국 동료들 간의 논의에서 게놈 데이터는 중국 CDC가 출판을 위해 재제출 중인 기존 Liu et al. 2022 프리프린트 (1)에 대한 업데이트의 근거가 된다고 설명했다.  

WHO 사무국, SAGO 의장 및 부회장과의 협의 후 3월 12일에 전화가 왔다.중국 CDC의 관련 과학자들과 GISAID의 데이터에 액세스한 일부 사람들과 함께 이 데이터의 중요성과 분석을 측정했습니다.WHO는 이후 2023년 3월 14일 SAGO의 모든 회원들과 회의를 개최하고 중국 CDC의 연구자들을 초청하여 최신 데이터 분석을 발표했다.WHO와 SAGO는 또, GISAID로부터 데이터에 액세스 한 것을 WHO에 통지한 연구원을 초빙해, 일시적으로 공개된 시퀀스의 분석을 발표했습니다.

중국 CDC와 초청된 국제 연구자들의 발표에 따르면 화난 수산물 도매 시장의 새로운 데이터가 제공되고 있다.여기에는 2020년 1월에 수집된 다양한 노점과 폐수 수집 현장의 환경 샘플의 메타 유전자 데이터가 포함되었다.이러한 데이터의 분석사스-CoV-2 염기서열 외에도 일부 샘플에는 인간 DNA와 SARS-CoV-2에 취약한 것으로 알려진 몇몇 동물의 미토콘드리아 DNA가 포함되어 있음을 시사한다.여기에는 야생 너구리, 말레이시아 고슴도치, 대나무 쥐의 DNA가 SARS-CoV-2 양성 환경 샘플에 포함되었습니다.

조사 결과는 중국 당국의 공중 보건 조치의 일환으로 2020년 1월 1일 시장이 정리되기 직전에 동물들이 시장에 있었다는 것을 암시한다.이러한 결과는 SARS-CoV-2의 중간 숙주와 시장에서 인간 감염의 잠재적 원인을 식별하는 데 잠재적인 단서를 제공한다.

중국의 저자 프리프린트(Liu et al 2022)에 따르면, 2020년 초 시장 내 환경과 동물로부터 수집된 샘플 중 73/923개의 환경 샘플에서 SARS-CoV-2 특이 RT-qPCR 양성 반응이 나왔다.하지만 실험한 457마리의 동물 샘플에서는 바이러스가 검출되지 않았다.동물 표본에는 동물 사체, 냉동 동물 사체, 동물 제품뿐만 아니라 시장 주변의 떠돌이 동물들도 포함되었고 18종이 포함되었습니다.프리프린트에 따르면 너구리는 실험 대상 동물에 포함되지 않았다.그러나 새로운 분석에서 확인된 환경 샘플의 메타게노믹스 데이터에서 높은 수준의 너구리 미토콘드리아 DNA의 존재는 너구리와 다른 동물들이 시판되기 전에 존재했을 수 있다는 것을 암시한다.공중 보건 개입의 일환으로 청소되었습니다.

너구리와 다른 동물들이 과거에 이러한 특정 노점에서 판매되었다는 역사적 사진 증거가 제공되었다.비록 이것이 바이러스의 중간 숙주나 기원에 대한 결정적인 증거를 제공하지는 않지만, 데이터는 인간 감염의 원인이었을 수 있는 민감한 동물이 시장에 존재한다는 추가적인 증거를 제공한다.

SAGO는 중국인과 세계 각지의 다른 연구자들이 공유하는 모든 과학적 데이터를 계속 평가할 것이다.SAGO는 SARS-CoV-2의 기원 연구와 관련된 모든 데이터를 즉각 이용할 수 있도록 적극적이고 포괄적인 검토를 권고하고 있다.

SAGO의 예비 보고서 (2)에서 언급되었듯이, SAGO는 중국 연구자들에게 2020년 1월 1일 모든 동물 제품의 폐쇄 및 제거 직전에 화난 시장에 존재하는 동물 및 동물 제품의 상류 출처를 조사할 것을 강력히 권고하고 있다.

또한 SAGO는 이용 가능한 모든 염기서열 및 메타게노믹 데이터를 GISAID 또는 기타 염기서열 데이터베이스에 공개하고 검토 중인 프리프린트를 가능한 한 빨리 공유하여 과학계가 이를 더 분석할 기회를 갖기를 바란다.또한 SAGO는 이 데이터를 사용하여 연구자들이 중국인과 협력하고 협력할 것을 권장합니다.연구자.WHO와 SAGO는 이러한 협업을 촉진할 수 있게 되어 기쁘게 생각합니다.

(1) 류 외 연구진, 2022.화난 수산물시장 2개소의 환경 및 동물 샘플에 대한 SARS-CoV-2 감시, 이용 가능: https://www.researchsquare.com/article/rs-1370392/v1

(2) SAGO(신규 병원체의 기원을 위한 과학 자문 그룹)의 예비 보고서 2022년 6월, 입수 가능:https://www.who.int/publications/m/item/scientific-advisory-group-on-the-origins-of-novel-pathogens-report

링크:

스테이트먼트: https://www.who.int/news/item/18-03-2023-sago-statement-on-newly-released-sars-cov-2-metagenomics-data-from-china-cdc-on-gisaid

SAGO: 새로운 병원균의 기원을 위한 과학 자문 그룹(SAGO) (who.int)

COVID-19: 코로나바이러스(who.int)