비과세 급여의 정의 및 산전후휴가 급여 지급액 작성 문의.

[연탄머리]

안녕하세요.

직원이 01월부터 출산휴가를 들어갔습니다.
산전후휴가 작성시 no.11 산전후휴가 통상임금 지급 명세에 기입해야 할 급여지급액에 관해 문의드립니다.
해당 직원은 당사 기업부설 연구소 직원으로 급여항목은 기본급+연구수당(비과세)+식대(비과세)로 구성되어있는데 명세서 작성시 비과세 금액을 제외한 기본급+과세 내역만 합산하여 고용노동부에서 지급될 135만원을 제외한 나머지 금액을 회사에서 지급하면 되는걸로 알고 있습니다.

그런데 직원께서 문의해주시길 " 기업부설연구소 소속으로 20만원까지 기본급에서 할당하여 비과세혜택을  받는것으로 구분 정리한 것일 뿐  통상임금의 비포함 사유가  되지 않다고 봅니다.  첨부의 근로기준법 시행령의  6쪽 별표의 통상임금포함사례 3번 그리고 6번이 그에 해당하는  것으로 보임"(통상임금산정 지침 개정 전문 참고해주세요) 이라 하시는데, "연구수당"에 관한 비과세 정의가 정확히 이해가 되질 않아서요.