고전시대에도 물론 영산으로 취급받긴 했지만, 그 격은 지금보다는 낮았던 듯하다. 721년에 완성된 히타치국풍토기(常陸国風土記)이 이런 내용이 있다.
옛날 조상신께서 신들이 많은 곳을 다니시다가 스루가의 후지산에 도착하셨다. 해가 저물자 하룻맘 머물게 해달라고 부탁했지만, 후지산신은 "추수제(新嘗祭)를 지내느라 금기를 지키는 중입니다. 오늘만은 양해해주십시오. 머물게 해드릴 수 없습니다"라고 하였다. 조상신은 원망하며 욕을 하기를 "다른 이도 아니고 너의 조상인데 어찌 머물지 못하게 하느냐. 네가 사는 산은 살아있는 한 겨울에도 여름에도 눈이 내리고 서리가 끼며 추위가 덮쳐서, 사람들이 산에 오르지 않아 음식을 바치지도 않을 것이다"하였다.
이번에는 쓰쿠바산(筑波山)에 가셔서 부탁하시자, 쓰쿠바산신은 "오늘밤에 추수제를 하는 중입니다만, 조상님을 기분 상하게 해드릴 수는 없군요"하면서 대접하여 모셨다. 그러자 조상신은 기뻐하며 축복의 노래를 부르셨다.
"사랑스럽구나, 후손아. 높게 섰는가 신령의 궁전이여. 하늘과 땅, 해와 달이 무궁한 것처럼 사람들이 시 신성한 산에 올라 축하하리라. 음식은 풍부하고 우리 일족은 언제까지나 번성하여 즐거움이 무궁하라리라."
이런 이유로 후지산은 눈이 와서 올라갈 수 없다. 그러나 쓰쿠바산은 사람들이 모여들어 노래하고 춤추며 먹고 마시는 것이 지금까지 끊이지 않는다.
여기서 말하는 쓰쿠바산은 오늘날 이바라키현에 있는 해발 877 m짜리 산이다. 현재는 후지산의 위엄이나 위용으로 묘사하는 '높은 산 정상에 눈이 쌓인 모습'을 과거에는 오히려 오르기 어렵게 한다는 이유로 저주로 보고, 후지산보다 한참 낮은 쓰쿠바산에 사람들이 많이 모이는 것을 축복이라고 여겼다.
일본에서는 신성한 산에 종교적 의미로 오를 경우 등산이라는 말 대신 등배(登拜)라는 말을 쓰는데, 후지산도 등배의 대상이었다.
세계 각지의 명산들에 비해 경사가 심하지 않고 등산로 관리가 잘 된 편이라서 국민 대다수가 오를 수 있는 이른바 '국민 산'으로도 불린다. 유료도로인 스바루 라인을 이용하면 5고메(5合目 = 5부 능선) 주차장까지 사륜차, 이륜차, 또는 자전거 등으로 오를 수 있고, 5고메에서부터 출발하면 당일치기 등반도 가능하다. 물론 이것은 여름철(7월~8월)의 이야기. 애당초 등산로의 정식 개방은 7월과 8월 뿐이다. 또한 등산로 마다 개방 시기가 다르다 등산하기 전 모든 등산로의 개방 날짜를 확인하고 갈 것. 또한 재설작업이 늦어지면 개방일이 지연될 수 있으니 역시나 한번 더 확인하고 등산을 하길 바란다.
만약 등반에 도전할 생각이라면 준비를 잘 갖추는 편이 좋다. 우선 짐을 최대한 가볍게 하되, 반드시 외투를 챙긴다. 설령 5고메가 한여름 날씨일지라도 8고메(8부 능선)부터는 겨울 날씨가 된다. 등산 스틱이 없으면 5고메에서 막대기를 천엔 내외로 파니 꼭 하나 사가자. [6]고산병[7][8]
후지산의 정상은 일본에서도 상당히 추운 곳 중 하나이다. 1월 평균기온 -18.4℃, 8월 평균기온은 6.2℃로 1년 내내 밤엔 영하로 내려가곤 한다. 극단적으로는 1981년 2월 -38℃를 기록한 적도 있다.
2013년 6월 22일 오후 6시, 유네스코는 후지산을 세계유산에 등록한다고 결정했는데, 원래는 자연유산으로 등재를 할려고 했으나, 등산객들이 버린 쓰레기에 더해 등산로 화장실에 분뇨가 넘처 흐르는 관계로 무산되었다. 등산로는 자연훼손이 심하며, 지질학적으로 세계의 유명 산들에 비해 딱히 특별하다고 볼 수 없다는 점이었다. 일본 정부는 자연유산 등재를 위해 친환경 화장실을 등산로 주변에 세우는 등 법석을 떨었으나 결국 문제를 해결하지 못했다. 결국 자연유산 등재는 퇴짜 맞았지만 일본은 환경 평가에 관대한 문화유산 등재에 재도전하여 결국 등재에 성공하였다. 후지산이 일본 문화에 중요한 상징이며 수많은 그림과 문학 작품의 소재가 되는 등 문화적인 가치가 충분하다고 판단한 결과로 추정된다.
그런데 이전부터 이미 후지산에는 환경문제가 극성을 부리고 있었는데, 세계문화유산으로 등록되면서 등산객이 더욱 몰려 환경문제가 더 나빠졌고(...), 결국 이런 문제를 해결하지 못하면 유네스코가 문화유산 등록을 취소할 수도 있다고 했다는 발표까지 나왔다.#
의외로 일본인들도 한국인들처럼[9] 잘 모르는 사실이 있다. 후지산의 8할은 사유지라는 것. 물론 사찰의 사유지이긴 하지만.
일본에서의 후지산에 대한 속담으로 '한 번도 후지산을 오르지 않은 사람은 바보, 두 번 오른 사람 또한 바보(富士山に一度も登らぬ馬鹿、二度登る馬鹿)'란 속담이 있다. 일본인들이 후지산에 대해 가지고 있는 애정과, 막상 올라가 보면 참 별거 없는(...), 과대평가가 심한 곳이란 중의적인 의미를 내포하고 있다.[10]