더 큰 패널은 더 많은 유전자 돌연변이, 백혈병 치료 표적 발견
데이트:
2021 년 2 월 1 일
출처:
오거스타 대학 조지아 의과 대학
요약:
현재 다양한 암을 진단하고 미세 조정하는 데 사용되는 패널보다 약 10 배 많은 암 유발 유전자를 찾는 유전자 패널이 가장 흔한 백혈병에서 문제가되는 유전자를 식별하는 데 효과적이라고 연구자들은보고했다.
현재 다양한 암을 진단하고 미세 조정하는 데 사용되는 패널보다 약 10 배 많은 암 유발 유전자를 찾는 유전자 패널이 가장 흔한 백혈병에서 문제가되는 유전자를 식별하는 데 효과적이라고 연구자들은보고했다.
암을 유발할 수있는 것으로 알려진 모든 유전자를 포함하는 샌디에고에 본사를 둔 생명 공학 회사 인 Illumina가 개발 한 523- 유전자 패널은 급성 골수성 백혈병 (AML)을 진단하기 위해 임상 실험실에서 사용하기 위해 쉽게 채택 될 수 있다고 연구진은 저널에보고했습니다. PLOS ONE .
개인의 암에서 더 많은 유전 적 돌연변이를 확인하는 것은 또한 그 환자에 대한 더 많은 표적 치료를 가능하게한다고 그들은 말한다. 여기에는 이전에 암 유형과 관련이 없었던 돌연변이를 발견하는 것이 포함되며, 이는 전통적으로 다른 암에 대해 사용 된 돌연변이를 표적으로 삼는 약물을 사용할 수있는 기회를 제공합니다.
"더 큰 패널은 우리에게 더 많은 목표를 제공합니다"라고 Augusta University의 Georgia 의과 대학 병리학과의 중개 연구 부의장 인 Dr. Ravindra Kolhe는 말합니다.
연구의 교신 저자 인 Kolhe는 "우리가 여기서 발견 한 것 중 일부는 백혈병에 대한이 523 개 패널이 혈액 암의 일상적인 분자 프로파일 링을위한 임상 실험실을위한 실용적이고 임상 적으로 관련된 도구라는 것"이라고 말합니다.
AML은 연구자들이 점점 더 배우고 있기 때문에 관련된 유전자 돌연변이가 두 환자에서 동일하지 않을 수 있기 때문에 모든 환자에게 뚜렷한 질병입니다. Georgia Cancer Center 및 AU Health에서
연구 공동 저자 인 Kota는“ '백혈병'이라는 용어는 광범위하며 모든 사람을 똑같이 치료해서는 안됩니다. "이는 동일한 치료가 일부에게는 효과가 있고 다른 사람에게는 효과가없는 것으로 보는 이유 중 하나입니다."
MCG 연구자들은 백혈병이 확인 된 40 명의 환자와 27 명의 환자에 대한 자세한 임상 정보를 포함하여 61 개의 골수 샘플을 후 향적으로 분석했습니다.
더 큰 패널은 292 개의 유전자에서 880 개의 변이를 확인했으며 변이의 14.8 %만이 현재 많은 실험실에서 사용중인 작은 54- 유전자 패널에 포함 된 유전자에 있었다고 그들은 썼다. 나머지 749 개의 변종은 일반적으로 백혈병 진단에서 평가되지 않거나 54- 유전자 패널에 의해 검출되지 않는다고 그들은 지적합니다.
후속 조치에서 749 개의 변이에 대한 정보를 살펴보면, 10 개 유전자의 변이 중 최소 14 개가 AML에 기여할 가능성이 있으며 환자의 96.2 %가 14 개의 새로운 변이 중 최소 하나를 가지고 있음을 발견했습니다. 그들은 또한 AML 환자의 대다수에서 다른 종양 유형과 관련된 5 개의 다른 유전자에서 22 개의 변이를 발견했습니다.
환자에서 확인 된 새로운 변이는 환자에게보다 완전한 진단과 예후를 제공하고 암 관련 돌연변이를보다 직접적으로 표적으로 삼는 치료를보다 잘 식별하는 데 중요 할 수 있다고 그들은 말합니다.
다양한 유형의 암에 기여하는 돌연변이가 종종 중복되며 존재하는 돌연변이에 대한 광범위한 평가는이를 식별하는 데 도움이 될 것입니다.
코타는 "우리가 더 많이 알수록 백혈병에 대한 우리의 지식과 치료 방법을 확장합니다."라고 말합니다. Kolhe는 "다른 암에있는 유전자에서 비정상적인 것을 발견하면 이러한 약물을이 환자에게 사용할 수 있습니다."라고 덧붙입니다.
"희망은 이러한 돌연변이를 더 많이 찾는 것입니다. 우리는 더 이상 암을 이름으로 부르지 않고 돌연변이로 치료합니다."라고 Kota는 말합니다.
Kolhe가 지휘하는 Georgia Esoteric and Molecular Laboratory는 의심스러운 변화를 찾기 위해 DNA의 작은 부분을 증폭하는 데 사용되는 중합 효소 연쇄 반응과 같은 확립되었지만 덜 포괄적 인 방법과 결과를 비교하여 523- 유전자 패널을 국내 최초로 검증했습니다. . 이 연구를 위해 그들은 또한 523 유전자 패널에서 동일한 골수 샘플을 여러 번 실행했으며 매번 본질적으로 100 % 일관성을 발견했습니다. 그들은 또한 패널에 의해 확인 된 특정 돌연변이를 찾기 위해 개별 테스트를 수행했으며, 그것들은 패널의 결과와 일관되게 동등했습니다. 그들은 더 큰 패널이 임상 민감성, 특이성, 정밀도 및 정확성에 거의 100 % 효과적이라는 것을 발견했습니다.
Kota는 "이것은 개별 환자의 암에 기여하는 유전자 돌연변이에 대한 이해를 높이는 비용 효율적인 방식으로 실험실에서 일상적으로 지속적으로 수행 할 수있는 패널입니다."라고 말합니다.
표본 크기가 작다는 점에 주목했지만 두 가지 돌연변이로 진단받은 23 세 남성에게서 7 개의 돌연변이를 발견하는 것과 같은 흥미로운 임상 적 상관 관계가있었습니다. 그들이 발견 한 새로운 돌연변이에는 현재 백혈병 및 기타 암과 관련된 두 가지 새로운 변종이 포함되어 있다고 그들은 말합니다. 더 큰 패널에서 확인 된 유전자 돌연변이 수가 가장 많은 환자는 4 개월 2 일만 살아 남았습니다.
Kota는 AML 치료의 실질적인 발전없이 수십 년이 지났지 만 올해는 작은 유전자 패널로 확인 된 6 개의 돌연변이를 표적으로하는 6 개의 신약이 승인되었습니다. Kolhe는 새로운 패널이 해당 신약 번호를 최소 10 배 이상 확장하는 데 도움이되기를 희망합니다.
"더 큰 패널을 갖는 것은 암과 관련된 돌연변이에 대해 이미 알고있는 것을 확인하는 것뿐만 아니라 새로운 돌연변이를 식별하는 것"이라고 Kolhe는 말합니다.
Kolhe는 "우리가하는 일은 50- 유전자 패널을 가져와 523- 유전자 패널로 다음 단계로 나아가는 것입니다. 우리의 목표 중 하나는 향후 5 년 내에 60 개의 새로운 표적을 식별하는 것입니다."라고 Kolhe는 말합니다.
대부분의 AML 재발 환자는 진단 후 3 년 이내에 재발하고 치료 목표를 더 광범위하게 식별하면 이러한 비율이 개선 될 것이라고 말합니다.
National Comprehensive Cancer Network는 AML 검사에 현재 AML의 원인으로 알려진 6 개 이상의 유전자에 대한 분자 분석을 포함 할 것을 권장합니다.
현재 지침은 또한 포괄적 인 예후 평가를 위해 다중 유전자 패널 및 차세대 시퀀싱의 사용을 제안합니다. 차세대 시퀀싱은 523- 유전자 패널과 같은 고 처리량 접근 방식으로 조사자가 한 번에 많은 수의 유전자, 심지어 하루에 전체 게놈까지 효율적으로 시퀀싱 할 수 있습니다. 시퀀싱이란 질병을 유발하는 변화를 찾기 위해 DNA의 4 개 염기쌍 (A, T, C, G)의 순서를 살펴 보는 것을 의미합니다.
Kota와 Kolhe는 더 작은 유전자 패널이 비용과 시간 효율적이지만 몇 가지 알려진 핫스팟 돌연변이의 누락을 포함하여 불완전한 돌연변이 프로파일을 제공한다고 말합니다. 혈액 암과 다른 암의 분자 이질성에 대한 이해가 높아짐에 따라 더 광범위한 평가가 논리적이라고 그들은 말합니다. 그들은 더 넓은 패널의 비용이 6 개의 AML 관련 유전자에 대한 테스트보다 높지 않다는 점에 주목합니다.
골수에서 나온 혈액 줄기 세포는 감염과 싸우는 데 도움이되는 백혈구와 골수 세포라고하는 조혈 세포를 모두 생산하며 AML은 둘 다에 영향을 미칠 수 있습니다.