절차는 암 진행 위험이있는 Barrett의 식도 환자를 식별합니다
데이트:
2021 년 3 월 29 일
출처:
존스 홉킨스 의학
요약:
새로운 연구에 따르면 식도 칫솔질과 수집 된 샘플의 광범위한 유전 적 시퀀싱의 조합은 Barrett 's Esophagus 환자의 염색체 변화를 감지하여 식도암으로 진행할 위험이있는 환자를 식별 할 수 있습니다.
Johns Hopkins Kimmel Cancer Center 및 Case Western의 새로운 연구에 따르면 식도 솔질과 수집 된 샘플의 광범위한 유전 적 시퀀싱의 조합은 Barrett 's Esophagus 환자의 염색체 변화를 감지하여 식도암으로 진행될 위험이있는 환자를 식별 할 수 있습니다. 예비 대학.
Barrett 's Esophagus (BE)에서 위로부터의 만성 위산 역류는 하부 식도를 둘러싸고있는 세포를 손상시켜 하부 소화계의 세포처럼 보이게합니다. 하부 식도의 세포는 여러 전암 단계를 거쳐 진행 한 후 때때로 식도 선암 (5 년 생존율이 20 % 미만인 암)으로 발전합니다. BE는 식도 선암의 유일한 알려진 전구체입니다.
임상의는 대부분의 암 세포에서 공통적 인 특징 인 이수성 (aneuploidy)으로 알려진 염색체 변화를 찾아 BE에서 이러한 진행 상태를 감지 할 수 있지만 지금까지이 과정에는 여러 가지 생검이 포함되었습니다.
RealSeqS라는 시퀀싱 기법과 결합 된 단일 식도 솔질은 BE 진행의 여러 단계에서 이수성을 식별 할 수있을만큼 민감하고 특이하며 특정 유형의 이배 수성을 질병의 특정 단계와 일치시킬 수도 있다고 연구원들은 말합니다.
"이수성 (Aneuploidy)은 오랫동안 식도암의 발생, 시작 또는 진행과 관련되어 왔지만이를 검출하기위한 분석 또는 실험 방법은 우리가 임상 시행을 허용하고자하는 것만 큼 쉽게 달성되지 않았거나 높은 처리량을 제공하지 못했습니다"라고 수석 연구는 말합니다. 저자 Chetan Bettegowda, MD, Ph.D., Jennison 및 Novak Families 교수는 Kimmel Cancer Center의 신경 외과 교수입니다.
이 방법은 임상의가 식도 선암으로 BE가 진행될 위험이 더 높은 사람들을 식별하는 데 도움이 될 수 있으며, "이러한 환자에 대해 더 집중적 인 후속 조치를 취하거나 질병의 초기 단계에서 치료를 시작합니다."라고 Bettegowda는 말합니다.
결과는 1 월 21 일 Gastroenterology 저널에 온라인으로 게재되었습니다 .
식도 칫솔질은 내시경에 부드러운 브러시 부착물을 사용하여 식도 내막에서 세포를 수집합니다. 이 방법은 일반적인 생검보다 더 넓은 식도 표면적에서 세포를 샘플링 할 수 있습니다. 종종 칫솔질을 사용하는 내시경 검사는 "Barrett 's 환자를위한 표준 치료의 일부입니다"라고 Bettegowda는 말합니다. 따라서 이수성 검출 방법을 통합해도 임상 실습이 크게 바뀌지 않습니다.
브러싱을 통해 샘플링 된 수백 개 중 몇 개의 세포 만이 이수성을 나타낼 수 있으므로 브러싱과 대규모 병렬 시퀀싱을 결합하는 것이 이러한 세포를 찾는 데 중요합니다. 연구진은 RealSeqS라는 기술을 사용하여 게놈의 350,000 개 이상의 영역을 조사하여 특정 염색체 팔 변경을 식별했습니다. RealSeqS는 일반적으로 200 개 세포 중 약 1 개 수준에서 이수성을 검출 할 수 있는데, 이는 식도 칫솔질의 대부분이 정상 세포에서 파생 될 때 필요하다고 RealSeqS를 설계 한 Kimmel 센터 연구원 인 Christopher Douville은 말합니다.
Douville은 "이 방법은 빠르고 수백 개의 샘플을 비용 효율적으로 처리 할 수 있으므로 BE 연구에 이상적인 선택입니다."라고 말합니다.
연구진은 BE가없고 BE가없고 비정상 세포가없는 환자, BE가 있고 저 등급 또는 고급 세포 이상이있는 환자, 식도 선암 환자로부터 식도 칫솔질을 얻었습니다. 그들은 79 명의 환자의 샘플을 사용하여 세포 이상이없는 BE 환자와 선암 환자를 구별하기 위해 식별 시스템을 훈련했습니다. 그런 다음 연구팀은 268 명의 환자의 샘플을 조사하여이 방법이 BE 진행의 여러 단계를 구별 할 수 있는지 테스트했습니다.
Bettegowda, Douville 및 그들의 동료는 고 등급 세포 이상 및 선암 환자를 세포 이상이없는 BE 환자와 구별하는 이수성의 역치를 확인했습니다. 이 임계 값에서 방법은 232 또는 86.7 %의 사례에서 고위험 환자를 식별했습니다.
이 방법은 또한 BE 진행의 각 단계에서 선암으로의 특정 염색체 팔 변화를 확인했습니다. 이러한 특정 변화 중 일부는 이전 연구에 의해 이미 질병 단계와 연결되어 있지만 "진단 또는 예후 방식으로 사용할 수있을만큼 포괄적이지 않았습니다"라고 Douville은 말합니다.
연구원들은 이러한 변화를 사용하여 BE 진행 단계를 구별하기 위해 BAD (Barrett의 이수성 결정)라고하는 평가 도구를 개발했습니다. BAD 도구는보다 공격적인 질병과 관련된 분자 변화를 지적하기 때문에이 도구는 세포 생검이 양성으로 보일 때 고위험 개인을 식별하는 데 특히 유용 할 수 있다고 Bettegowda는 말합니다.
"이수성 (Aneuploidy)은 현재 우리가 암에 대해 찾을 수있는 것처럼 보편적 인 바이오 마커이므로 우리는이 기술을 다양한 암에 어떻게 사용할 수 있는지 보게되어 기쁩니다"라고 그는 말합니다. "우리는 RealSeqS 분석의 다양성을 고려할 때 다른 질병 과정, 다른 암 유형을 연구하고 잠재적으로 더 일찍 개입 할 다른 방법을 찾을 수 있다는 점을 낙관합니다."
이 작업은 국립 보건원의 보조금 CA150964, CA163060, CA152756 및 UH3 CA205105-03에 의해 지원되었습니다. Burroughs Wellcome Career Award for Medical Scientists로부터 RA37 CA230400-01, U01CA230691, Oncology Core CA 06973 보조금; 비 혈장 액체 생검을 사용한 암의 조기 발견; Virginia and DK Ludwig Fund for Cancer Research; Johns Hopkins의 Sol Goldman 시퀀싱 시설; 그리고 콘래드 R. 힐튼 재단.
이 작업에 기여한 다른 사람들은 Case Western Reserve University에서 왔습니다. 노스 캐롤라이나 대학교; 및 Mayo Clinic.
공동 저자 인 Kenneth Kinzler, Nickolas Papadopoulos 및 Bert Vogelstein은 Thrive 및 Personal Genome Diagnostics의 창립자이자 지분을 보유하고 있습니다. Kinzler와 Papadopoulos는 Thrive 이사회의 컨설턴트이며 이사회에 있습니다. Kinzler와 Vogelstein은 Personal Genome Diagnostics, Sysmex, Eisai 및 CAGE Pharma의 컨설턴트입니다. Vogelstein은 Catalio의 컨설턴트이기도하며 형평성으로 보상받습니다. Kinzler, Papadopoulos 및 Vogelstein은 Neophore의 컨설턴트입니다. Bettegowda는 Depuy-Synthes 및 Bionaut Labs의 컨설턴트입니다. Douville은 Thrive의 컨설턴트이며 소득과 형평성을 보상받습니다. 위에 언급 된 회사와 다른 회사는 Johns Hopkins University에서이 백서에 설명 된 작업과 관련하여 이전에 설명 된 기술에 대한 라이선스를 취득했습니다. Douville, Bettegowda, Kinzler, Papadopoulos와 Vogelstein은 이러한 기술 중 일부를 발명했습니다. 이러한 기술에 대한 라이센스는 발명가 및 Johns Hopkins University에 대한 지분 또는 로열티 지불과 관련이 있거나 관련됩니다. 이러한 모든 계약 조건은 이해 상충 정책에 따라 Johns Hopkins University에서 관리하고 있습니다.