비인가 전원형 중등 대안학교
금산간디학교, 꽃피는학교, 곡성평화학교, 느티울 행복한학교, 늦봄문익환학교, 다인학교, 마리학교, 멋쟁이학교, 문화교육들살이, 민들레학교, 빛고을학교, 산돌학교, 산청간디중학교, 삼무곡자연예술학교, 실상사작은학교, 아힘나평화학교, 영남전인학교, 영천산자연학교, 전인자람학교, 제천간디학교, 지혜학교, 참꽃작은학교, 평화학교, 푸른숲발도르프학교, 학교너머, 한알학교, 햇살나무학교
비인가 도시형 중등 대안학교
공간민들레, 꽃피는학교, 꿈꾸는아이들의 학교, 꿈타래학교, 꿈틀학교, 난나학교, 꿈터학교, 단재학교, 도시속작은학교, 사람사랑나눔학교, 성미산학교, 성장학교별, 셋넷학교, 스스로넷 미디어스쿨, 아름다운학교, 은평씨앗학교, 하자작업장학교, 한들대안학교ㅡ 가온학교, 거침없는우다다학교, 더불어가는배움터길, 도시속참사람학교, 두레학교, 들꽃피는학교, 디딤돌학교, 불이학교, 시소학교, 온새미학교, 파주자유학교, 큰나무 학교, 하나인학교, 하늘씨앗살이학교
인가받은 대안학교
간디고등학교, 경기대명고등학교, 경주화랑고등학교, 공동체비전고등학교, 달구벌고등학교, 동명고등학교, 두레자연중고등학교, 산마을고등학교, 송지송학중학교, 세인고등학교, 양업고등학교, 영산성지고등학교, 용정중학교, 원경고등학교, 이우학교, 전인고등학교, 지리산고등학교, 지평선중고등학교, 팔렬고등학교, 푸른꿈고등학교, 한겨레중고등학교, 한마음고등학교, 한빛고등학교, 헌산중학교