미꾸리와 미꾸라지는 외형이 아주 유사하지만 염색체 수가 달라 유전적으로도 구분되며, 미꾸리는 꼬리지느러미 상단에 1개의 흑점이 있고, 입수염의 길이가 눈지름의 2.5배 정도로 비교적 짧아 꼬리지느러미 상단의 흑색 점이 불분명하고 입수염의 길이가 눈지름의 4배 정도로 비교적 긴 미꾸라지와 구분된다(그림 1). 양식 어업인들은 이러한 특징을 살려 각각 “둥굴이”와 “넙죽이”로 잘 구분하고 있다.