이어 2013년 9월에는 서울 정부청사에서 국무조정실 국정운영실장 주재 대안 논의를 통해 해양수산부는 ‘강진만 해역환경변화 조사용역’을 시행하고 강진군과 수자원공사는 용역비 공동부담을 통해 ‘강진만 패류감소 원인조사용역’을 실시하기로 했다.
그러나 2014년 해수부 용역을 위한 예산이 정부예산에 반영되지 않아 강진군 어업인들의 원성을 자아내다가 2015년 강진원 군수와 황주홍 의원실의 계속된 노력으로 인하여 정부예산 3억원이 성립되어 용역 입찰을 거쳐 전남대학교와 목포대학교 등 7개 기관이 공동 컨소시엄을 구성, 2015년 6월 용역을 시행하게 되었다.