1.써던블랏팅에서 5번과정에서 모세관현상을 이용해서 겔에서 NC필터로 DNA를 전이함.
밑에 두꺼운종이를 깔고 그 위에 NC필터, 또 그 위에 아가로오스겔 그리고 그 위에 종이한장을 덮어서 물의 모세관현상을 이용해
겔에서 NC필터로 DNA를 전이하는것보다 그냥 처음부터 NC필터위에 아가로오스겔 두고 물을 뿌리면 안되나요?
2. 연어정자 DNA를 뿌려서 NC필터를 코팅하는이유가 탐침이 필터에 비특이적으로 결합하는것을 막음.
그러면 연어정자 DNA라는것이 일단 탐침과 수정란,B세포의 DNA와 상보적이지 않다는것을 알고있고,
그리고 탐침이 NC필터위에 UV쏴서 DNA가 고정된 부분이 아닌곳에 뿌려지면 연어정자DNA로 코팅된것에 의해
탐침이 상보성이있는곳을 찾아가게되나요?
3. 연어정자DNA가 코팅되있으면 탐침이 상보적인 DNA와 결합시 결합을형성하는데 장애물같은역할은 하지않나요?
첫댓글 1. 네 종이에서 종이로 물이 스며드는정도의 힘이 DNA를 전이하기에 적당합니다.
3. 약간의 장애가 될 수는 있을겁니다. 하지만 비특이적인 결합을 줄여주므로 실험결과의 정확성은 훨씬 올라갑니다.
답변 잘 해 주셨습니다. 2. 탐침이 찾아가는게 아니라 전체적으로 뿌리면 그 중 상보성이 있는 서열에만 붙어서 남게 됩니다.
연어정자 DNA를 뿌리는것이 탐침이 필터에 비특이적으로 결합하는것을 막는것인데
어차피 NC필터는 DNA가 붙질못하고 통과해버리니까 굳이 연어정자DNA를 안뿌리고 탐침을 뿌리면 그에 해당하는
DNA에 붙으면 결합이되면 그 이후 물로 씻겨내면 결합한 DNA는 필터에 남고 안붙은것은 떨어져나갈테니
연어정자DNA를 쓸필요없는거아닌가요?
추가적으로 HCl용액에 넣으면 DNA가닥의 퓨린염기들중 일부가 떨어져나간다.에서
AT가 이중수소결합이라서 더 약해서 CG 삼중수소결합보다 더 잘 떨어져나가는것이지
G염기도 떨어져 나가긴하는거지요??