첫댓글결합이 어렵고 혼성화되기 어려우니깐 무조건 반응온도가 낮아야 된다고 생각하신거 같아요. pcr에서의 온도는 이중가닥 분리에 부분에 초점이 맞춰 있어요. 우선 gc결합이 많으면 이중가닥이든 primer와 주형가닥 사이의 결합이 강하기 때문에 해리시키려면 온도를 높일수 밖에 없어요 아마 primer길이가 길어질수록 반응온도가 높아져야 하는것도 primer가 결합된 주형가닥을 분리시키기 위함으로 해석하시는게 맞다고 봅니다. 간단히 말하자면 온도를 높이는 이유는 이중가닥 분리를 위해서다 라고 말할수 있네요
DNA길이가 길수록, GC함량이 높을수록 denature온도가 높아지잖아요? denature이냐 hybridization이냐가 딱 결정되는 지점을 최적온도라고 해볼게요. 최적온도보다 높으면 hybridization이 안되는 거고, 최적온도보다 낮으면 비특이적인 hybridization이 되는 것이다. 이렇게 생각하면 되겠네요. DNA가 길수록, GC함량이 높을수록 최적온도가 높으니까 step2에서 온도가 높아진다. 이렇게 대략적으로 이해해주시면 될듯.
첫댓글 결합이 어렵고 혼성화되기 어려우니깐 무조건 반응온도가 낮아야 된다고 생각하신거 같아요.
pcr에서의 온도는 이중가닥 분리에 부분에 초점이 맞춰 있어요.
우선 gc결합이 많으면 이중가닥이든 primer와 주형가닥 사이의 결합이 강하기 때문에 해리시키려면 온도를 높일수 밖에 없어요
아마 primer길이가 길어질수록 반응온도가 높아져야 하는것도 primer가 결합된 주형가닥을 분리시키기 위함으로 해석하시는게 맞다고 봅니다.
간단히 말하자면 온도를 높이는 이유는 이중가닥 분리를 위해서다 라고 말할수 있네요
그렇군요 사고를 역으로 해야 정답이 되는군요. 즉. primer와 dna 혼성화 과정에서도 혼성화되는 온도가 아닌 pcr후 프라이머와 dna를 분리시키려는 온도에 기준을 맞추는 것이네요. 그렇게 정리하겠습니다. ^_^ 친절한 대답 감사합니다.
DNA길이가 길수록, GC함량이 높을수록 denature온도가 높아지잖아요?
denature이냐 hybridization이냐가 딱 결정되는 지점을 최적온도라고 해볼게요. 최적온도보다 높으면 hybridization이 안되는 거고, 최적온도보다 낮으면 비특이적인 hybridization이 되는 것이다. 이렇게 생각하면 되겠네요. DNA가 길수록, GC함량이 높을수록 최적온도가 높으니까 step2에서 온도가 높아진다. 이렇게 대략적으로 이해해주시면 될듯.
친절한 대답 감사합니다. ^_^